Основная часть исследований, проводимых в РХГА, осуществляется на проектной основе за счет внутренних ресурсов и внешних грантов. Гранты направлены на формирование начальной стадии проекта и его завершение, которое становится, как правило, возможным в результате получения внешнего финансирования со стороны фондов, министерств и комитетов, а также частных источников. Российские частные вузы не имеют систематического финансирования своей научной деятельности со стороны государства, которое в нашей стране остается пока основным инвестором научной сферы. Согласно данным мониторинга эффективности работы российских вузов за 2012 год по показателю финансирования научной деятельности РХГА входит в первую двадцатку российских вузов и научных центров.
Такой подход является результатом долгосрочной политики, проводимой вузом. Ее составляющие – ценностная ориентация гуманитарных исследований, качество исполнения поставленных задач, дисциплина и организационная мобильность. Сам вуз был изначально создан на идеях - целостного гуманитарного образования, которое предполагает междисциплинарный подход в противовес узко специализированному; построения образования на определенной ценностной платформе; особого внимания к отечественной культуре.
Образовательная, научная, книгоиздательская и информационная деятельность РХГА являются по сути дополняющими друг друга сторонами одного и того же процесса. Направления исследований, выражающиеся в реализации конкретных проектов, соответствуют направлениям подготовки специалистов, бакалавров, магистров и аспирантов. В числе лидирующих – философия, культурология, религиоведение, филология, теология. Большинство исследовательских проектов завершаются публикацией в бумажном и (или) электронном виде: статьями, книгами (антологиями, сборниками, монографиями), информационными ресурсами, размещенными в сети или на носителях.
Наиболее показательной и в определенном смысле центральной для работы вуза является известная научно-просветительская серия «Русский Путь: pro et contra», в рамках работы над которой, начиная с 1994 года, подготовлено более 100 томов и двух десятков инфоресурсов.
Историю и планы развития проекта отражает статья Д.К.Богатырёва «Серия «Русский Путь: pro et contra» как метод распространения и систематизации гуманитарного знания», опубликованная в «Вестнике Российского гуманитарного научного фонда».
Качество и дисциплина исполнения проектов подтверждаются, в частности, оценками работы вуза со стороны руководства РГНФ.
Организационная мобильность, приверженность ценностям, сочетание внутреннего и внешнего финансирования делают РХГА эффективным и результативным субъектом научной деятельности среди российских образовательных и научных организаций гуманитарного профиля.